В связи с начавшейся Карабахской войной, Бейляр в 1992 году оставил учёбу и отправился добровольцем на фронт. Принимал активное участие в боях за Лачин. 6 августа1992 года погиб в бою[1].
Память
Указом президента Азербайджанской Республики № 350 от 7 декабря1992 года Агаеву Бейляр Тапдыг оглы было присвоено звание Национального Героя Азербайджана (посмертно)[2][3].
Похоронен Бейляр Агаев на Аллее Шахидов родного села Караагач[2].