4 мая 1923 года апостольский викариат Маршалловых Островов был объединён с апостольским викариатом Каролинских и Марианских островов (сегодня — Епархия Каролинских островов).
23 апреля 1993 года Римский папаИоанн Павел II выпустил буллуQuo expeditius, которой воссоздал апостольскую префектуру Маршалловых островов после разделения епархии Каролинских и Маршалловых Островов.