Апостольская делегатура в Перу была создана в 1829 году. До 1836 года находилась под юрисдикцией апостольских делегатов и папских представителей в Бразилии. делегатура в Перу была соединена, с 1836 года по 1861 год с папским представителем в Колумбии, а затем, с 1861 года по 1877 год, с папским представителем в Эквадоре. В 1877 году были установлены дипломатические отношения между Святым Престолом и Перу, с возникновением апостольской интернунциатуры Перу и Боливии. 20 июля 1917 года была создана Апостольская нунциатура в Перу, с резиденцией в Лиме.