Бароха — воспитанник клуба «Каракас» из своего родного города. Первые сезоны он был запасным и не выходил на поле. В 2010 году Бароха стал чемпионом страны. Для в 2011 году получения игровой практики Алайн перешёл «Льянерос». 28 августа в матче против «Яракуянос» он дебютировал венесуэльской Примере[3]. Отыграв сезон Бароха вернулся в «Каракас». 12 августа 2012 года в матче против «Саморы» он дебютировал за столичный клуб[4]. В 2014 года Алайн стал обладателем Кубка Венесуэлы.
Летом 2016 года Бароха вернулся в Каракас, но почти сразу же был отдан в аренду в уругвайский «Суд Америка». 3 сентября в матче против «Вилья Эспаньола» он дебютировал в уругвайской Примере[6]. Летом 2017 года Алайн на правах аренды присоединился к «Монагас». 22 октября в матче против «Метрополитанос» он дебютировал за новый клуб[7]. По итогам сезона Бароха стал чемпионом Венесуэлы.
