Начинал играть в родном Мурманске. С сезона 1990/91 в течение восьми сезонов играл за череповецкий клуб «Металлург» / «Северсталь». В 1998 году подписал двухлетний контракт с петербургским СКА[1]. В феврале 2000 перенёс операцию на мениске[2]. Летом 2000 года Болтунов совместно с Максимом Соколовым и Алексеем Козневым был отдан в аренду в «Северсталь»; в качестве компенсации СКА должен был получить 5-6 игроков[3][4][5]. По ходу сезона 2001/02 вернулся обратно в СКА. Сезон 2004/05 отыграл в «Северстали». В сентябре 2005 года перешёл в «Сибирь»[6]. Завершил карьеру в том же сезоне в воскресенском «Химике».