Зимой[6] того же года Вальтер на правах свободного агента перешёл в «Боку Хуниорс». 8 июля в матче Кубка Либертадорес против эквадорского «Индепендьенте дель Валье» он дебютировал за новый клуб[7]. 16 октября в поединке против «Атлетико Сармьенто» Боу забил свой первый гол за «Боку»[8]. В 2017 году он помог клубу выиграть чемпионат. В следующем году повторил это достижение, хотя в основном составе Боу стал появляться несколько реже.