С 1562 году занимался на южных рубежах государства обороной от участившихся набегов крымских татар, однако вскоре вернулся на западный театр военных действий и принял участие в походе на Полоцк. За доблесть при его взятии был пожалован в окольничие. В 1565 году был одним из воевод в Пскове. С 1567 года в ранге боярина жил при дворе Ивана Грозного.
Авдеев А. Г., Энговатова А. В. Захоронение Ивана Андреевича Бутурлина в Троице-Сергиевом монастыре: к вопросу о дате казни и посмертной участи опального // Проблемы истории, филологии, культуры. 2025. — № 1. — С. 200—211.