В сезоне 1997 года, а также с 2004 по 2006 год «Вентспилс-2» играл в Первой лиге Латвии. В 2007 году начали проводить чемпионат дублёров клубов Высшей лиги, в котором стал играть молодёжный состав «Вентспилса».
После сезона 2009 года чемпионат дублёров прекратил своё существование, но так как в Высшую лигу был приглашён другой вентспилсский клуб — «Транзит», то восстанавливать «Вентспилс-2» не стали, а все резервы вложили в данный фарм-клуб.
В конце сезона 2010 года руководство «Транзита» решило отказаться от дальнейшего участия в Высшей лиги Латвии[3][4], а сам клуб было решено реорганизовать в «Вентспилс-2» и в дальнейшем играть в Первой лиге[5].
