Воспитанник футбольной школы запорожского «Металлурга», тренер — Александр Рудыка.
Первый круг сезона 2007/08 провёл на правах аренды в клубе «Кривбасс». По итогам сезона 2010/11 «Металлург» занял последнее 16 место и вылетел в первую лигу. В том сезоне Вернидуб провёл 21 матч.
29 декабря 2011 года перешёл в луганскую «Зарю», подписав контракт на 5 лет[4].
11 июня 2015 года перешёл в азербайджанскую «Габалу»[5]. По окончании сезона 2017/18 покинул клуб[6]. В июне 2018 года подписал с «Зарёй» соглашение сроком на два года[7].