Испанская академия кинематографических искусств и наук учредила премию «Гойя» для признания лучших работ испанского кинематографа в различных категориях. Первая церемония прошла 16 марта 1987 года в мадридскомТеатре Лопе де Вега. Были вручены награды в 15 номинациях, сейчас номинаций 28.
В 2000 году церемония в первый раз проводилась не в столице Испании. В этом году вручение премии проходило в Барселоне.
В 2005 году на церемонии вручения премии «Гойя» впервые присутствовал председатель правительства страны Хосе Луис Родригес Сапатеро. После этой церемонии в адрес Испанской социалистической рабочей партии прозвучали обвинения в политизации кинопремии (фильм «Море внутри», снятый Алехандро Аменабаром, был номинирован на премию «Гойя» в 15 различных категориях и в конечном итоге получил 14 наград).
В настоящее время премия вручается в 28 номинациях, не считая Премии «Гойя» за заслуги. С XIII церемонии установлено максимальное количество кандидатов на каждую награду в количестве четырёх (на второй и третьей церемониях максимальное количество составило 5, а на всех оставшихся — 3 номинанта).