Мохаммад Али Джафари родился 1 сентября 1957 года в городе Йезд. Начальное и среднее образование получил в родном городе. В 1977 году поступил на учёбу в Тегеранский университет в столице Ирана. В Тегеранском университете изучал строительство.
Ранее командовал Сухопутными силами КСИР с 1992 по август 2005 года.
В 1999 году после подавления студенческих волнений в Тегеране он был одним из 24 офицеровКСИР, которые написали письмо президенту Мохаммаду Хатами, выразив свою озабоченность произошедшим и недовольство тем, что к подавлению выступлений была привлечена армия[1].