Насарено — воспитанник клуба «Барселона» из города Гуаякиль. Из-за высокой конкцренции он не мог дебютировать за команду, но регулярно попадал в заявку на матчи. В 2008 году Джованни на правах аренды перешёл в «Депортиво Кито». В новой команде он получал недостающее игровое время, дебютировал в эквадорской Серии А и помог команде в стать чемпионом страны в своём первом сезоне.
В 2009 году Насарено вернулся в «Барселону». 9 марта в матче против ЛДУ Портевьехо он забил свой первый гол за клуб из Гуаякиль[3]. В 2012 году Джованни во второй раз стал чемпионом Эквадора.
Насарено не смог выиграть конкуренцию за место в основе и в начале 2017 года перешёл в «Дельфин». 25 февраля в матче против «Универсидад Католика» он дебютировал за новую команду[6]. 2 июля в поединке против ЛДУ Кито Джованни забил свой первый гол за «Дельфин»[7].