Начинал карьеру в тунисском футбольном клубе «Сфаксьен». Дебютировал за основную команду 26 сентября 2012 года в 29-м туре чемпионата против «Кайруана». Команда Н’Донга победила со счётом 1:0[1]. В сезоне 2012/13 провёл 18 игр и забил 1 гол, включая матчи плей-офф[2]. Клуб завоевал титул чемпиона Туниса[3]. Также в этом сезоне команда выиграла Кубок Конфедерации КАФ — африканский аналог Лиги Европы УЕФА. В сезоне 2013/14 сыграл 16 матчей в чемпионате, забил 1 гол[4]. В сезоне 2014/15 сыграл 5 матчей.
В начале 2015 года перешёл в клуб «Лорьян», играющий во французской Лиге 1. В сезоне 2014/15 сыграл за команду 12 матчей в чемпионате. Голов не забил[5]. В сезоне 2015/16 сыграл 34 матча, забил 2 гола[6].
Летом 2016 года перешёл в английский «Сандерленд»[7]. В сезоне 2016/17 сыграл 31 матч и забил 1 гол в чемпионате[8]. В первой половине сезона 2017/18 сыграл 18 матчей в Чемпионшипе[9]. В январе 2018 года отправился в аренду в «Уотфорд» до конца сезона.
1 января 2019 года полузащитник ФК «Сандерленд» Дидье Ндонг перешел в ФК «Генгам»[10]. Сыграл 11 матчей в чемпионате[11].
В 2013 году играл за сборную Габона в возрастной категории до 20 лет на чемпионате Африки среди юношей до 20 лет. Провёл на поле 3 матча в рамках группового этапа. В плей-офф сборная не вышла.
За взрослую сборную дебютировал 14 ноября 2012 года в товарищеском матче против сборной Португалии. Встреча завершилась вничью со счётом 2:2.
Играл за сборную на Кубке Африки 2015. Провёл 3 матча на групповом этапе. В плей-офф команда не пробилась.
