В 1957 году город Богор был передан из апостольского викариата Джакарты в апостольскую префектуру Сукабуми.
3 января1961 года Римский папа Иоанн XXIII издал буллу Quod Christus, которой преобразовал апостольскую префектуру Сукабуми в епархию Богора, при этом кафедра была перемещена из города Сукабуми в Богор.
Ординарии епархии
епископ Paternus Nicholas Joannes Cornelius Geise OFM[1](17.12.1948 — 30.01.1975);
епископ Ignatius Harsono (30.01.1975 — 17.07.1993);
епископ Cosmas Michael Angkur O.F.M. (10.06.1994 — 21.11.2013);