1 мая1929 годаРимский папаПий XI издал буллу«Universi Dominici», которой учредил епархию Консепсьона и Чако, выделив её из епархии Асунсьона (сегодня — Архиепархия Асунсьона). 11 марта 1948 года епархия Консепсьона и Чако передала часть своей территории для образования нового апостольского викариата Чако-Парагвайо. 16 июля 1949 года епархия Консепсьона и Чако была переименована в епархию Консепсьона.
В следующие годы епархия Консепсьона передала часть своей территории для образования новых церковных структур:
21 февраля 1957 года — территориальной прелатуре Энкарнасьона и Альто-Параны (сегодня — Епархия Энкарнасьона);
2 августа 1960 года — территориальной прелатуре Каакупе (сегодня — Епархия Каакупе);
10 сентября 1961 года — территориальной прелатуре Коронеля-Овьедо (сегодня — Епархия Коронеля-Овьедо);