30 апреля1991 года Римский папа Иоанн Павел II выпустил буллу Quod Praelatura Xinotegana, которой преобразовал территориальную прелатуру Хинотеги в епархию.
Ординарии епархии
епископ Pedro Lismaco de Jess Vlchez Vlchez (18.06.1982 — 10.05.2005);
епископ Carlos Enrique Herrera Gutirrez (10.05.2005 — по настоящее время).