4 марта 1964 года Римский папаПавел VI издал буллу «Venerabilis Frater», которой учредил территориальную прелатуру Чулуканаса, выделив её из епархии Пьюры. 12 декабря 1988 года территориальная прелатура Чулуканаса была преобразована в епархию.
Ординарии епархии
епископ Juan Conway McNabb (4.03.1964 — 28.10.2000)
епископ Daniel Thomas Turley Murphy (28.10.2000 — по настоящее время)