Унаследовав убеждения отца, он продолжал его политику. Участвовал в заговоре с целью освобождения Греции от османского господства. Когда его замыслы были раскрыты турецкому правительству французским посланником Себастиани, Ипсиланти бежал в Россию, отделавшись лишь конфискацией имущества. Его попытки склонить императора Александра I к активной политике в пользу Греции не увенчались успехом; русские власти относились с крайней подозрительностью к его оживлённым сношениям с революционерами Балканского полуострова.
В 1806 году во главе 20 тысячной русской армии вернулся в Бухарест. Тильзитский мир положил конец его планам по освобождению Греции.
Константин Ипсиланти умер в Киеве, оставив после себя пять сыновей, трое из которых (Александр, Дмитрий и Георгий) были офицерами русской армии и сыграли важную роль в войне за независимость Греции. На его старшей дочери Елене (1788—1837)[1] был женат российский дипломат греческого происхождения Александр Фёдорович Негри.