Круспски — воспитанник клуба «Арсенал» из Саранди. 1 ноября 2020 года в матче против «Униона» он дебютировал в аргентинской Примере[1]. 7 марта 2022 года в поединке против своего бывшего клуба «Лануса» Факундо забил свой первый гол за «Арсенал»[2].
В начале 2023 года Крупски перешёл в аравийский «Абу-Даби». 23 января в матче против «Бани Яс» он дебютировал в чемпионате ОАЭ[3]. 28 января в поединке против «Аль-Васла» Факундо забил свой первый гол за «Аль-Вахда»[4].