Летом того же года он перешёл в УАНЛ Тигрес. После вылета команды в Ассенсо лигу, Франсиско дважды помогал ей возвращаться обратно в элиту. В 1995 году Крус подписал контракт с «Атланте», но уже по окончании сезона вновь переехал в Европу. Его новой командой стал софийскийЦСКА, с которым Франсиско выиграл чемпионат и Кубок Болгарии. В 1997 году он вернулся в УАНЛ Тигрес, после чего недолго выступал за «Монтеррей» и американский «Сан-Антонио Пумас». В 1999 году Крус завершил карьеру.