Кунева окончила юридический факультет Софийского университета в 1981 году. В 1984 году она стала доктором юридических наук.
В 2002—2006 годах Меглена Кунева занимала пост министра по европейским вопросам. В 2007—2009 годах стала первым еврокомиссаром от Болгарии, занимала пост еврокомиссара по защите прав потребителей.
На президентских выборах 2011 года заняла третье место.
С 2012 года она председатель либеральной партии «Болгария для граждан», которая была одним из основателей Реформаторского блока в 2013 году.
7 ноября 2014 года заняла должность вице-премьера по координации европейской политики и институциональным вопросам во втором правительстве Бойко Борисова[3]. С 3 февраля2016 года совмещала эту должность с должностью министра по образованию и науке.
Связь с семейством Прымовых
Муж Меглены Куневой — Андрей Прымов — сын видного функционера БКПИвана Прымова, инициатора расстрела забастовщиков в Пловдиве4 мая1953 года. Родственная связь Куневой с покойным Прымовым-старшим нередко используется её политическими оппонентами в качестве компрометирующего штриха[4][5].