Андрес Матонте родился в 1988 году в Монтевидео. По профессии является учителем физкультуры. В возрасте 20 лет начал работать футбольным судьёй в любительских и низших лигах чемпионата Уругвая. Впервые начал работать на матчах Первого дивизиона в 2017 году. В 2019 году Матонте получил статус арбитра ФИФА[1].
На международной арене в 2019 году Матонте работал только в качестве резервного арбитра. Впервые в качестве главного судьи Андрес отработал в матче Кубка Либертадорес 2020 между «Депортиво Тачирой» и «Индепендьенте Медельином» (2:0). Игра второго квалификационного этапа состоялась 12 февраля 2020 года[2]. Продолжает регулярно судить матчи важнейших клубных турниров Южной Америки.
В мае 2022 года Андрес Матонте был включён ФИФА в список арбитров, которые будут работать на матчах финального турнира чемпионата мира 2022 года в Катаре[1].
В октябре 2022 года прокуратура Уругвая начала расследование в отношении Андреса и его брата Роберто Марсело Матонте в связи с различными сообщениями, указывающими на мошенничество[4].
В мае 2024 года был отобран одним из главных судей для обслуживания матчей Кубка Америки по футболу, который состоится в июне-июле 2024 года на футбольных полях США.