Мерентиель — воспитанник клуба «Пеньяроль». В 2017 он был включён в заявку команды на сезон и сразу же был отдан в аренду в «Эль Танке Сислей». 19 февраля в матче против «Серро» он дебютировал в уругвайской Примере[2]. 26 февраля в поединке против столичного «Ливерпуля» Мигель забил свой первый гол за «Эль Таке Сислей»[3]. Летом того же года Мерентиель был арендован испанской «Лоркой». 26 августа в матче против «Уэски» он дебютировал в Сегунде[4]. 30 сентября в поединке против «Кадиса» Мигель забил свой первый гол за «Лорку»[5]. В 2018 году он на правах аренды играл за дублёров «Валенсии».
В 2023 году Мерентиель перешёл в «Бока Хуниорс» на правах аренды. 5 февраля в матче против «Сентраль Кордова» он дебютировал за новый клуб[12]. 19 февраля в поединке против «Платенсе» Мигель забил свой первый гол за «Бока Хуниорс»[13]. По окончании аренды клуб выкупил трансфер игрока. 10 августа в матче Кубка Либертадорес против «Насьоналя» он забил гол[14]. 26 апреля 2024 года в поединке Южноамериканского кубка против «Форталезы» Мигель забил гол[15].
