В ноябре 1937 года был арестован и в этом же году расстрелян[4].
Д. Д. Шостакович писал: «Евгений Семенович Микеладзе был выдающимся советским дирижёром. Он обладал огромным талантом и большой общей и музыкальной культурой. За время своей работы в Тбилиси он очень много сделал для развития грузинской музыкальной культуры. Микеладзе был гордостью советской дирижёрской школы»[5].
Личная жизнь
Был женат на Кетеван Мамиевне Орахелашвили, (1914-1985) в семье родилось двое детей — дочь Тинатин Микеладзе, врач (1935-2003) и сын — Вахтанг Микеладзе (1937-2025) — советский и российский режиссёр-документалист.
В фильме «Покаяние» Тенгиза Абуладзе история его ареста и гибели и ареста его жены лежит в основе сценария картины.
Награды
орден Трудового Красного Знамени (14.01.1937)[8] — за выдающиеся заслуги в деле развития грузинского оперного искусства, грузинской музыки, песен и танцев