Главой правительственного аппарата Сухопутных войск являлся министр Сухопутных войск с аппаратом заместителей и помощников министра и секретариатом Министерства. По структуре 1873 года в состав Министерства входили:
Министр
Секретариат
Управления:
1-е (секретное)
2-е (административное)
3-е (артиллерии)
4-е (инженерное)
5-е (финансовое)
6-е (оперативное)
В проекте структуры предусматривался 7-е (северное) управление, которое должно было представлять командование Сухопутных войск на о. Хоккайдо, однако проект не был реализован.
В 1878 г. на базе оперативного управления Министерства был сформирован самостоятельный Генеральный штабСухопутных войск, подчиненный напрямую Императору как Верховному Главнокомандующему и осуществлявший оперативное планирование боевого применения Сухопутных войск.
В 1879 г. правительство пересмотрело структуру и правила работы Министерства. В нем организовывалось пять функциональных управлений: административное, кадровое, артиллерийское, инженерных войск и финансовое. В 1885 г. дополнительно было сформировано транспортное управление.
1886 г.
В 1886 г., в связи с реформой правительства и формированием Кабинета министров, Министерство стало возглавляться министром с личной канцелярией, было добавлено управление медслужбы Сухопутных войск.
В 1888 г. было сформировано правовое управление, а в 1890 г.административное и управление и управления родов войск были слиты в единое войсковое управление.
В мае 1900 г. была проведена очередная реформа: право становиться руководителями министерства получили военнослужащие чином не ниже генерал-лейтенанта, гражданские лица не допускались на высшие посты .
С 1913 г. гражданские лица получили право на руководящие посты, однако с 1936 г. военные снова получили монопольное право на эти должности. Министр и коллегия министерства формировались исключительно из офицеров Императорской армии Японии, что способствовало усилению влияния военных на руководство страны. Активное участие в принятии правительственных решений принимали руководители войскового управления министерства, занимавшиеся межродовой координацией Сухопутных войск. До 1930 г. в состав постоянных управлений Министерства были добавлены также управления вооружений и тыла.
Весной 1945 г., накануне поражения во Второй мировой войне, войсковое управление Министерства было слито с 4-м управлением Генштаба для организации решающего сражения при планировавшейся обороне метрополии на суше.
Ликвидация МинистерстваСухопутных войск
Министерство Сухопутных войскИмператорской Японии было распущено осенью 1945 г. после подписания акта о капитуляции. Выполнение демобилизационных работ Сухопутных войск было поручено вновь сформированному Демобилизационному управлению №1 из бывших сотрудников Министерства.