Молина вошёл в Августинский орден в 1694 году и преподавал в школе августинцев Севильи. Молина занимался частными делами короля Филиппа V. Он был назначен епископом Кубы в 1730 году, епископом Барселоны в 1731 году. В 1734 году он был переведён в епархию Малаги. Был председателем Совета Кастилии. Во время консистории 1737 года папа Климент XII возвёл Молина в сан кардинала. В конклаве 1740 года участия не принимал.
Внезапно скончался 30 августа 1744 года в Мадриде, в возрасте 65 лет и был похоронен в монастыре Сан-Фелипе-Реаль.