Мыстковский является воспитанником «Ягеллонии». В конце сезон 2013/2014 стал привлекаться к тренировкам с основной командой. 31 мая 2014 года дебютировал в польском чемпионате в поединке последнего тура против «Краковии», выйдя на замену после перерыва вместо Павела Дражбы[1]. На тот момент футболисту было только 16 лет.
В сезоне 2014/2015 Мыстковский появлялся на поле семь раз, в основном выходя на замену в концовках матчей. В сезоне 2015/2016 отметился выходами уже в 15 поединках, в трёх из них — в основном составе. 14 мая 2016 года забил свой первый мяч в профессиональном футболе в ворота «Короны»[2].
Карьера в сборной
Выступал за юношеские сборные Польши до 16 и 17 лет. Принимал участие в отборочных матчах к юношескому чемпионату Европы 2015 года, однако в финальную часть вместе с командой не попал.