Нава — воспитанник клуба «Толука». 5 октября 2010 года в матче против «Крус Асуль» он дебютировал в мексиканской Примере, выйдя на замену вместо Эктора Мансильи[3]. 30 ноября в поединке против «Эстудиантес Текос» Рауль забил первый гол за «Толуку»[4]. В 2009 и 2010 годах Нава дважды стал чемпионом Мексики.
В 2012 году на правах аренды он перешёл в клуб «Тихуана». 28 июля в матче против «Леона» Нава дебютировал за новую команду[5]. В «Тихуане» Рауль не был основным футболистом и лишь раз вышел на поле в стартовом составе. Несмотря на это он был причастен к историческому чемпионству клуба.