Ндиайе — воспитанник клуба «Дакар Сакре-Кур». В 2020 году игрок подписал контракт с французским «Олимпик Лион», где присоединился к молодёжной команде. Летом 2022 года Ндиайе перешёл в «Бастию» на правах аренды. 6 августа в матче против «Ньора» он дебютировал в Лиге 2[1]. В этом же поединке Абдулайе забил свой первый гол за «Бастию». Летом 2023 года Ндиайе перешёл в «Труа». 5 августа в матче против «Дюнкерка» он дебютировал за новую команду[2].