В 1951 году Нипикло перешёл в дортмундскую «Боруссию», в которой продолжилась его основная карьера. В составе «Боруссии» Нипикло отыграл девять сезонов и в 1956 и 1957 годах становился чемпионом страны[2]. Нипикло в составе «шмелей» был одним из лучших бомбардиров Западной Оберлиги, поскольку в сезоне 1955/56 он забил суммарно 34 гола[2]. Нипикло вместе с Прайслером и Кельбассой составлял результативную атакующую линию, которая была известна в то время как «Три Альфреда»[2].
Всего за дортмундскую «Боруссию» Нипикло сыграл 183 игры и забил 107 голов в Западной Оберлиге[2].