Обьенг — воспитанник клубов «Утрера» и «Бетис». В 2017 году игрок дебютировал за дублирующий состав последних. В 2018 году Эстебан вернулся на правах аренды в «Утреру», а затем уже на постоянной основе стад игроком клуба. В 2019 году Обьенг перешёл в «Ивису», где в основном выступал за дублирующий состав. В 2021 году Эстебан выступал за «Атекеру». Летом 2022 году Обьенг подписал контракт с румынским «Киндия Тырговиште». 28 августа в матче против «Арджеша» он дебютировал в чемпионате Румынии[1]. 16 октября в поединке против «Миовени» Эстебан забил свой первый гол за «Киндия Тырговиште»[2].
В 2023 году Обьенг перешёл в «Арджеш». 10 ноября в матче против «Унири Слобоза» он дебютировал за новую команду[3].
