30 марта 1920 года епископом Пименом (Пеговым) был рукоположён во иерея ко Крестовоздвиженскому храму в местечке Маково.
В 1929 году был арестован, осужден по статье 58-10 УК РСФСР и приговорен к трём годам исправительно-трудовых лагерей.
В 1932 году по отбытии срока выслан в Северный край на 3 года.
По возвращении из ссылки назначен епископом Тульским Онисимом (Пылаевым) в церковь села Жмурово Чапаевского района Тульской области.
29 ноября 1935 года принял монашество с именем Онисифор. В январе 1936 года возведён в сан архимандрита.
С 25 августа 1937 года — настоятель церкви села Товарково Тульской области. С 15 ноября 1938 года — благочинный.
14 февраля 1945 года решением патриарха Московского и всея Руси Алексия I (Симанского) и Священного Синода РПЦ был определён епископом Пинским и Брестским.
27 февраля 1945 года в Москве хиротонисан во епископа Пинского и Брестского. Чин хиротонии совершали: Святейший Патриарх Алексий и архиепископ Тульский и Белёвский Виталий (Введенский)[1]. Иногда именовался Брестским и Пинским.