Охотская область первоначально управлялась комендантом, а с 1800 года — городничим. Уезды управлялись исправниками (кроме Нижнекамчатского, управлявшегося городничим)[1].
22 апреля 1805 года Охотская область была упразднена, а входившие в её состав уезды переданы в прямое подчинение Иркутской губернии[2].