С упразднением Новгород-Северского наместничества в 1796 году, Погарский уезд был расформирован. Основная часть его территории вошла в состав Стародубского уезда, а бывший уездный город Погар был определён как заштатный.
Ныне основная часть территории Погарского уезда входит в состав Брянской области.