Меню
Главная
Случайная статья
Настройки
|
Целью проекта «Биоинформатика» является создание и улучшение русскоязычных статьей, посвященных высокопроизводительным технологиям современной биологии и методам биоинформатического анализа данных. Улучшение статьей является частью учебного процесса студентов ФББ МГУ, ФКН ВШЭ и ШБ. Этот проект в значительной степени вдохновлен аналогичным проектом в МФТИ.
Содержание
Правила- Участники могут выбрать одну из статей представленных в таблице ниже или предложить статью самостоятельно, в этом случае статью необходимо согласовать с преподавателем.
- Целью работы является получение статьей статуса добротной или улучшения ее статуса в ряду добротная-хорошая-избранная. Улучшение статуса автоматически обозначает получение максимального балла. Пожалуйста, ознакомьтесь с требованиями к статье и процедурой выдвижения
- Над каждой статьей работают два студента: вы можете сами выбрать, с кем вы работаете над статьей.
- Выбрав статью, вы должны сами вписать свои имена и ники в таблицу ниже.
- Статью необходимо подготовить не позднее 24.04.2020 и прислать ссылку на нее преподавателю для проверки текста
- Статья, не получившая статус, может быть зачтена в том случае, если она
- Была согласована с преподавателем и выдвинута на статус добротной не позднее 03.05.2020
- Все замечания, высказанные опытными участниками Википедии до 03.05.2020, должны были учтены, а необходимые исправления внесены до 12.05.2020.
- Проверка будет осуществляться по состоянию на 12.05.2020
Кураторы проекта- Павел Мазин
Статьи, над которым работают участники проекта (2020 год)
Статья
|
Участники
|
Ники
|
Что сделать
|
Статус, дата сдачи
|
Количественный анализ экспрессии генов
|
|
|
улучшить структуру, расширить
|
|
Транскриптомика одиночных клеток
|
Потанина, Скаков
|
Darya Potanina
|
|
Согласовано 03.05.2020, получен статус
|
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
|
Азбукина, Мыларщиков
|
DmitryOne
|
|
Согласовано 20.04.20, номинировано, ведется работа
|
ChIP-seq
|
Мищенко, Галкин
|
Prosto polinushka, Scibroth
|
добавить новую информацию о модификациях, обновить информацию о софте
|
Согласовано 18.04.2020, номинировано
|
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
|
|
|
|
|
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
|
Кучеренко
|
Creepyorange
|
|
|
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
|
Бартыш, Гладнева
|
Katyabartysh, Eva Tern
|
|
Согласовано 12.04.2020, получен статус
|
Энциклопедия_элементов_ДНК
|
|
|
|
|
Молекулярный докинг
|
Елизарова
|
evel147
|
Дополнить информацией из литературы и статей
|
Согласовано 18.04.20, получен статус
|
Вложенная полимеразная цепная реакция
|
Буян, Кравченко
|
Павел Крав
|
Перевести на русский, обязательно добавить раздел про nested PCR в основную статью Полимеразная цепная реакция и связать с новой страницей
|
Согласовано 29.03.2020, получен статус
|
Полимеразная цепная реакция в реальном_времени
|
Чашникова, Миронова
|
mimiroha
|
Сделать текст более структурированным, дополнить совеременной информацией про приложения, связать с ChIP и Количественным анализом экспрессии
|
Согласовано 12.05.2020, номинировано, замечания учтены
|
16S рРНК
|
Гусева, Юдина
|
Eguseva
|
Дополнить, дописать, зачем используется и почему, связать с релевантными страницами
|
Согласовано 30.03.2020, получен статус
|
Методы секвенирования нового поколения
|
Веселова, Никитин
|
yas0n1a, Nikkent
|
Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры
|
Согласовано 23.04.2020, получен статус
|
Микробиом
|
Камышева, Шпудейко
|
|
Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры
|
Согласовано 29.03.2020, получен статус
|
Предсказание структуры белка
|
Угольков, Васильева
|
Ugol24d
|
Дополнить - перечислить подходы, софт, etc
|
Согласовано 20.04.2020, получен статус
|
Модель замен
|
|
|
Довести до добротной
|
|
FASTA
|
Бусыгин
|
DaydreamingElephant
|
Дополнить, довести до добротной
|
Согласовано 16.04.2020, получен статус
|
Молекулярная эволюция
|
Цветков, Григорьян
|
|
Расширить
|
Согласовано 22.04.2020, номинировано, проигнорированы замечания
|
Двугибридный анализ
|
Серебренникова, Морозов
|
|
Дополнить, сделать более читаемой.
|
Согласовано 23.04.2020, номинировано, ведется работа
|
Нанопоровое секвенирование
|
Календр, Рюмина
|
E.caterina Ryu, Romanbioengee
|
Дописать про методы анализа, довести до добротной
|
Согласовано 14.04.2020, получен статус
|
Количественный анализ альтернативного сплайсинга
|
Ириоглов, Черкашина
|
|
Дополнить примерами, структурировать
|
Согласовано 24.04.2020, номинировано
|
Сборка Golden Gate
|
Зинкевич
|
Arsen-z
|
Перевести на русский и доработать
|
Согласовано 20.04.2020, получен статус, статья рекомендована в хорошие.
|
ATAC-seq
|
Минина
|
Minina
|
Создание новой статьи
|
Согласовано 05.03.2020, получен статус
|
Эпигеномика
|
Минина
|
Minina
|
Создание новой статьи
|
Согласовано 05.03.2020, получен статус
|
Пространственная транскриптомика
|
Козюлина, Гурылева
|
|
Создание новой статьи
|
Согласовано 24.04.2020, получен статус
|
Биоинформатика
|
Попов А, Селифанова М
|
|
Привести в порядок, добавить актуальную информацию
|
|
Архив
(2019 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Статья
|
Участники
|
Ники
|
Что сделать
|
Статус
|
Групповой анализ дифференциальной экспрессии
|
Маргасюк, Посицельская
|
Sergey Margasyuk
|
|
получен статус
|
Количественный анализ экспрессии генов
|
Николаева
|
|
|
согласовано, требуются стилистические правки
|
Транскриптомика одиночных клеток
|
Исаев, Карпухина
|
serj.hop AnnShw
|
|
|
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
|
|
|
|
|
Секвенирование РНК
|
Морозова
|
morozova_ea
|
обновить
|
согласовано, получен статус
|
Визуализация данных секвенирования РНК
|
Волынкина, Галивонджян
|
InnaVolynkina
|
Добавить новую информацию, подробнее описать, подправить битые ссылки
|
согласовано, получен статус
|
Коррекция на множественное тестирование
|
Матвейшина, Котюргин
|
Mek1314
|
|
получен статус
|
ChIP-seq
|
Сефербекова, Теплова
|
zairasef, AdaTeplova
|
добавить новую информацию о модификациях, улучшить текст, связать с поиском пиков
|
согласовано, получен статус
|
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
|
|
|
|
|
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
|
|
|
|
|
секвенирование экзома
|
Карань, Пиунова
|
akartar.n,
|
|
согласовано, получен статус
|
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
|
|
|
|
|
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
|
Васильева, Шагиев
|
Yeessa, Cyber500
|
|
получен статус
|
Cytoscape
|
Кузнецова, Максимов
|
|
|
согласовано, получен статус
|
SAMtools
|
Аксенова, Панова
|
Maribish, Nooroka
|
|
согласовано, получен статус
|
Предсказание генов
|
Борисов, Зареченская
|
|
|
согласовано, получен статус
|
Проект «Раковый геном»
|
Рюмин, Чаплий
|
ruminkd, chaplyk
|
|
согласовано, получен статус
|
Энциклопедия_элементов_ДНК
|
|
|
|
|
AutoDock
|
Герасева, Преображенская
|
Geraseva
|
сделать текст более читаемым, улучшить структуру
|
согласовано, получен статус
|
Молекулярный докинг
|
Усманов, Положинцев
|
Rustamusmanov973, Temasonos
|
Дополнить информацией из литературы и статей
|
согласовано
|
Промотор
|
Литвин, Радкевич
|
Litvinanna, Emir.radkevich
|
Улучшить, добавить инструменты поиска
|
Согласовано, получен статус
|
Выравнивание последовательностей
|
Гавриш, Авдюнина
|
GGleb42WP, P.avdiunina
|
Расширить статью, добавить информацию
|
согласовано, получен статус
|
en:Chromosome conformation capture
|
Калашникова, Гладкова
|
AKalashnikova, Gladmarine
|
перевести, придумать русское название
|
согласовано, получен статус
|
(2018 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Статья
|
Участник[и]
|
Ник[и]
|
Групповой анализ дифференциальной экспрессии
|
Широковских, Байкузина
|
Tana_shir, P.baikuzina
|
Транскриптомика одиночных клеток
|
|
|
GenBank
|
Фролова, Шошинова
|
Froltasa, GloomyArmA
|
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
|
|
|
Коррекция на множественное тестирование
|
|
|
Визуализация данных секвенирования РНК
|
|
|
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
|
|
|
Модель_замен
|
Корзина
|
Askorzina
|
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
|
|
|
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
|
|
|
Секвенирование РНК
|
|
|
секвенирование экзома
|
|
|
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
|
|
|
Cytoscape
|
|
|
Теплокарта
|
Стариков, Ефремов
|
Staytunedpls, Aleks.a.efremov
|
Генная_онтология
|
Желтова, Самборская
|
Annetezv, margarita.samborskaya
|
SAMtools
|
|
|
Интерактом
|
Кашко, Кудрин
|
Natilika,
|
Предсказание генов
|
|
|
Проект «Раковый геном»
|
|
|
Энциклопедия_элементов_ДНК
|
|
|
FAIRE-Seq
|
Князева, Медведева
|
Naguest, Mmutilda
|
Секвенирование древней ДНК
|
Шугаева, Дианкин
|
Talianash, Warrdeyl
|
Формат файлов GFF
|
Сафронов, Мальков
|
Grigorij Saf, Ne0blako
|
en:N50,_L50,_and_related_statistics (перевод)
|
Горбачева, Ильницкий
|
DariaGorbacheva, ilnitsky_ivan
|
en:Pan-genome (перевод)
|
Николаева, Сигорских
|
Daria Nikolaeva, Andrey Sigorskikh
|
en:GENCODE (перевод)
|
Очередько, Бойко
|
Boiko.sash, elenaoch
|
en:De novo transcriptome assembly (перевод)
|
Макарова, Волик
|
makarve,
|
(2017 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Статья
|
Количество студентов на статью
|
Участник[и]
|
Ник[и]
|
Ensembl
|
2
|
Злобин, Маслова
|
alex_the_evil, Valmarfgecnf
|
Групповой анализ дифференциальной экспрессии
|
2
|
|
|
Мотив (молекулярная биология)
|
2
|
Молдован, Пензар
|
Arajmob,Dmitrypenzar1996
|
Транскриптомика одиночных клеток
|
2
|
Адамейко, Галкин
|
Delfinio, Radiation7
|
Метод дробовика
|
2
|
Беженцев, Сахарова
|
Malenkaya vrednaya polymeraza, Eka_Sa
|
ДНК-микрочип
|
2
|
Кузнецова, Ливенский
|
kuznetmaria, livenskyi
|
TopHat
|
2
|
Березина, Валяева
|
Krevetkakrevetochka, Annvalyaeva
|
KEGG
|
2
|
Скибина Е., Волосникова М.
|
ES Skibina, Marinarazdvatri
|
UniProt
|
2
|
Дидковская Н., Санжаева У.
|
Nataliyadi, USanzhaeva
|
Белок-белковые взаимодействия
|
2
|
Хвень, Яровенко
|
Irishkasuperfresh, Brokoro
|
AutoDock
|
2
|
Белоусов, Пушкарёва
|
belv, opushkareva
|
GenBank
|
2
|
Кузнецов, Софронова
|
|
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
|
2
|
|
|
Коррекция на множественное тестирование
|
2
|
Степаков, Менделевич
|
, Strausyatina
|
Логотип последовательностей
|
2
|
Рябых, Погорельская
|
alexapogorelskaya
|
Фармакогенетика
|
2
|
Безсуднова, Мухалева
|
Redgzb, Bezu
|
MEME
|
2
|
Хачатурян, Буянова
|
Zyukeriya, sonya_sofia7
|
Атлас ракового генома
|
2
|
Швецова, Корягина
|
theurgeforhappiness, liluoppi
|
BWA (выравнивание биологических последовательностей)
|
1
|
Prosvirov Kirill
|
Akado2009
|
STRING
|
1
|
Кононкова
|
A_Kononkova
|
Визуализация данных секвенирования РНК
|
1
|
|
|
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
|
1
|
Елена Шушкевич
|
ElenaShush
|
Модель_замен
|
1
|
|
|
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
|
1
|
|
|
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
|
1
|
|
|
Секвенирование РНК
|
1
|
Ася Стол
|
smartnbeautiful
|
секвенирование экзома
|
1
|
Дюгай Илья
|
|
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
|
1
|
Ксения Янкина
|
Salatcesar
|
Cytoscape
|
1
|
Ковальчук Михаил
|
kvlml
|
ChIP-seq
|
1
|
Ярослав Лозинский
|
Lozinsky.yaroslav
|
Теплокарта
|
1
|
Симонова Александра
|
alexandrevna
|
Генная_онтология
|
1
|
Сегодин Виталий
|
MC Poh
|
Метод присоединения соседей
|
1
|
Тихонова Полина
|
tikhonovapolly
|
Pfam
|
1
|
Мошенский Денис
|
loven-doo
|
SAMtools
|
1
|
Холина Татьяна
|
rainy_TK
|
Анализ метаболических потоков
|
1
|
Демкив Андрей
|
Andrey_demkiv
|
Байесовский подход в филогенетике
|
1
|
Худякова Ксения
|
khudyakova
|
Интерактом
|
1
|
Богдан Кириллов
|
Bakirillov
|
Позиционная весовая матрица
|
1
|
Сингх Лавприт
|
Preety
|
Предсказание генов
|
1
|
Чайников Антон
|
mrgutkun
|
Проект «Раковый геном»
|
1
|
Теванян Элен
|
Элен Теванян
|
Энциклопедия_элементов_ДНК
|
1
|
Филиппова Екатерина
|
edfilippova
|
FAIRE-Seq
|
1
|
Миронов Алексей
|
|
Секвенирование древней ДНК
|
1
|
Кунин Михаил
|
|
Формат файлов GFF
|
1
|
Ольга Васюткина
|
sunnymouse
|
Участник[и]
|
Ник[и]
|
Статья
|
Комментарий
|
Статус
|
дата окончания правки
|
Панкевич
|
Pankevich-ev
|
STARR-seq
|
перевод en:STARR-seq
|
согласовано
|
|
Образцова, Попов
|
Alcedattis
|
Пространственное_выравнивание
|
перевод en:Structural_alignment
|
согласовано
|
|
Гафуров, Меерсон, Носикова
|
FBA
|
Анализ_метаболических_потоков
|
перевод, en:Flux balance analysis
|
согласовано
|
|
Дудина, Елисеев, Малеева
|
Dudinadar, Glennerad
|
Секретомика
|
перевод, en:Secretomics
|
согласовано
|
|
Абдрахманов, Анисимова
|
SunnyBeque
|
Метагеномика
|
перевод en:Metagenomics
|
согласовано
|
|
Галкин Фёдор
|
|
Предсказание генов
|
перевод en:Gene_prediction
|
согласовано
|
|
Босхомджиева Баина, Андреева Анна
|
bainabos, lazyraccoon
|
Интерактом
|
перевод en:Interactome
|
согласовано
|
|
Гусев, Евстафьева, Желудкевич
|
zheludkevich.anna
|
Коррекция на множественное тестирование
|
доведение до статуса добротной
|
согласовано
|
|
Нуждина Екатерина
|
Alezanalp
|
BWA (выравнивание биологических последовательностей)
|
создание новой статьи, применение, алгоритмы, проблемы
|
список литературы согласован
|
|
Беседина Лиза, Вакуленко Юля
|
biobesedina, vakulenko_julia
|
Байесовский подход в филогенетике
|
Перевод en:Bayesian inference in phylogeny
|
согласовано
|
|
Шафиков Радик
|
iltarn.mos
|
Секвенирование ДНК одиночных клеток
|
создание новой статьи
|
согласовано
|
|
Травин Дмитрий, Трушина Наталия, Козлова Мария
|
TravinD, Nitrushina
|
Баркодирование ДНК
|
перевод en:DNA barcoding
|
согласовано
|
|
Мазитова Саша
|
AlMazitova
|
Метод дробовика
|
перевод en:Shotgun_sequencing
|
согласовано
|
|
Минькина Елена
|
Meatargz
|
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
|
создание новой статьи
|
согласовано
|
|
Тишина Соня, Федорова Алла
|
sonirabi, Triasteran
|
Множественное_выравнивание_последовательностей
|
перевод en:Multiple_sequence_alignment
|
согласовано
|
|
Марсиаль
|
Mahoul
|
Ensembl
|
перевод en:Ensembl
|
согласовано
|
|
Сутормин Дмитрий, Новикова Мария, Ежова Маргарита
|
sutormin94, Vadius Marie, rita501
|
Вызов пиков
|
создание новой статьи
|
согласовано, нет списка литературы
|
|
Кунин Михаил
|
mikhail_kunin
|
GenBank
|
перевод en:GenBank
|
согласовано
|
|
Медведев, Мамедов
|
D.o.medvedev, Z_Krookie
|
Фармакогенетика
|
перевод en:Pharmacogenetics
|
согласовано
|
|
Котлов
|
avkitex
|
AutoDock
|
перевод и дополнение AutoDock
|
согласовано
|
|
Бикметов
|
Bikdm
|
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
|
перевод en:Weighted correlation network analysis
|
Согласовано
|
|
Трофимов
|
|
Предсказание функции белка
|
перевод en:Protein_function_prediction
|
не согласовано
|
|
Участник[и]
|
Ник[и]
|
Статья
|
Комментарий
|
Статус
|
дата окончания правки
|
Алешин
|
Vasily msu11
|
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
|
улучшение существующей статьи
|
источники согласованы
|
|
Аккуратов
|
eakkuratov
|
визуализация данных РНК-сек
|
зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), …
|
источники согласованы
|
|
Галицына, Бредихин
|
Rilalim raordan, kerkomen
|
SAMtools
|
и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools
|
источники согласованы
|
|
Филаретов
|
Dragongene
|
Инкубатор:Sequence logo
|
может стоит придумать русское название en:Sequence_logo
|
источники согласованы
|
|
Столярова, Бутусова
|
taisniqm, amadreaera
|
Позиционная весовая матрица
|
en:Position_weight_matrix
|
источники согласованы
|
|
Клинк
|
GalkaKlink
|
Инкубатор:Групповой анализ дифференциальной экспрессии
|
GOstat, gorilla, goseq и т. д. Нужно придумать русское название.
|
|
|
Фоменко, Чаплин
|
lenafomenko, Chaplin_av
|
Инкубатор:Pfam
|
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam
|
источники согласованы
|
|
Девяткин
|
AndreiDeviatkin
|
методы изучения редактирования РНК
|
секция в Секвенирование_РНК
|
|
|
Ланина
|
No.lanina
|
Энциклопедия_элементов_ДНК
|
улучшение существующей статьи
|
согласован перевод
|
|
Моисеева
|
janemoiseeva
|
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
|
сайт проекта
|
|
|
Калинина, Новаковский, Елисеева
|
MarinaKalinina, fransilvion, julia-eliseeva
|
Атлас_Ракового_Генома
|
en:The_Cancer_Genome_Atlas
|
согласован перевод
|
|
Безменова, Сафина
|
bsshka, noraneko
|
Предпочтение кодонов
|
en:Codon Usage Bias, нужно придумать русское название
|
источники согласованы
|
|
Бурская, Сигалова
|
GreyCrow
|
Модель_замен
|
en:Substitution_model, нужно придумать русское название
|
источники согласованы
|
|
Артюхов, Прохорова
|
eugeniaprokhorova
|
Проект «Раковый геном»
|
en:Cancer Genome Project, en:COSMIC cancer database
|
|
Климчук
|
Olesyaklm
|
Инкубатор:STRING
|
en:STRING
|
|
|
Белова, Гречникова
|
|
секвенирование экзома
|
en:Exome Sequencing
|
согласован перевод
|
Максудов, Нафеев, Шарафиев
|
|
pipeline
|
|
|
|
Участник[и]
|
Ник[и]
|
Статья
|
Комментарий
|
Статус
|
дата окончания правки
|
|
|
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
|
улучшение существующей статьи
|
|
Кулешов
|
Maxim Kuleshov
|
ДНК-микрочип
|
улучшение существующей статьи
|
Источники одобрены
|
10.05.2014
|
Дворкина, Муравьева
|
DashaDv, Fox.fbb.msu
|
ПЦР в реальном времени
|
улучшение существующей статьи
|
Источники одобрены
|
09.05.2014
|
Шадрина, Захаров
|
Olya_ldvgr, Matvey zaharov 25
|
FAIRE-Seq
|
|
Источники одобрены
|
09.05.2014
|
Зотова, Акулич
|
Umbrella22
|
ChIP-seq
|
en:ChIP-sequencing
|
Источники одобрены
|
09.05.2014
|
Антоненко, Шилин
|
Eka-hal-lo, I.Shilin
|
Секвенирование древней ДНК
|
неандертальцы, денисовец и т. д
|
Источники одобрены
|
09.05.2014
|
Осипова
|
Elosip
|
Транскриптомика одиночных клеток
|
методы, проблемы, достижения
|
|
15.05.2014
|
Брильков
|
brilkov
|
Секвенирование ДНК одиночных клеток
|
методы, проблемы, достижения
|
|
Шехирева, Залевский
|
KsushaSh,Aozalevsky
|
Предсказание вторичной структуры РНК
|
en:Nucleic_acid_structure_prediction
|
Источники одобрены
|
9.05.2014
|
Аюпов, Андрианов
|
ARustam, Esquel roche
|
Мотивы последовательностей (ДНК, РНК и белков)
|
en:Sequence_motif
|
|
Шмаков, Ситник
|
Arxcaeli, Zaheridor
|
Белок-белковые взаимодействия
|
en:Protein–protein_interaction
|
Перевод
|
15.05.2014
|
Поршнев, Шашков
|
ShashkovS
|
MEME
|
принципы работы en:Multiple_EM_for_Motif_Elicitation
|
Источники одобрены
|
15.05.2014
|
Тахавеев, Кондратьев
|
Vakeel
|
Cytoscape
|
зачем нужен, основные применения en:Cytoscape
|
Источники одобрены
|
10.05.2014
|
Балакирева
|
|
TopHat
|
принципы работы, зачем нужен, альтернативы [1]
|
Источники одобрены
|
8.05.2014
|
|
|
визуализация данных РНК-сек
|
зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), ...
|
|
|
|
SAMtools
|
и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools
|
|
|
|
Bioconductor
|
en:Bioconductor
|
|
Гаранина, Гараева
|
irinagaranina, alice_garaeva
|
Теплокарта
|
улучшение существующей статьи
|
Источники одобрены
|
9.05.2014
|
|
|
Sequence logo
|
может стоит придумать русское название en:Sequence_logo
|
|
|
|
Позиционная весовая матрица
|
Position_weight_matrix
|
|
Гущина, Лунева
|
Gushchina
|
Генная_онтология
|
en:Gene_ontology
|
Источники одобрены
|
9.05.2014
|
|
|
Gene set enrichment analysis
|
GOstat, gorilla, goseq и т.д. Нужно придумать русское название.
|
|
Кузькина
|
karatuk
|
nj-tree
|
Нужно придумать русское название. Метод_присоединения_соседей
|
Перевод английской вики. Согласовано.
|
12.05.2014
|
Котляров
|
Nikmort
|
Коррекция на множественное тестирование
|
en:Multiple_comparisons_problem
|
|
Мансурходжаев, Васетенков
|
Tim
|
KEGG
|
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:KEGG
|
Источники одобрены
|
11.05.2014
|
Абдуллаев, Абашкин
|
, Dmitro_Fbb
|
Pfam
|
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam
|
Источники одобрены
|
Сернова
|
wild_cat_NVS
|
UniProt
|
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:UniProt
|
Источники одобрены
|
08.05.2014
|
Шарапова, Андреянова
|
Yana,ekaandreyanova
|
Формат файлов GFF
|
en:General_feature_format
|
Источники одобрены
|
09.05.2014
|
Иванова, Цепкова
|
Della FeniX,
|
Секвенирование_РНК
|
улучшение существующей статьи
|
|
09.05.2014
|
|
|
методы изучения редактирования РНК
|
секция в Секвенирование_РНК
|
|
|
|
Энциклопедия_элементов_ДНК
|
улучшение существующей статьи
|
|
Участник[и]
|
Статья
|
Комментарий
|
Статус
|
Александров, Аюпов
|
Methyl Array
|
www.illumina.com
|
Источники одобрены
|
Вербицкая
|
Бисульфитное секвенирование
|
Русская статья сильно меньше английской
|
Перевод с английского
|
Анисенко, Золотарев, Галиева
|
Открытый хроматин
|
необходимо активное взаимодействие с участниками, пишущими про DNase и FAIRE
|
Источники одобрены
|
Братцева, Ибрагимов
|
DNase-seq
|
DNase I hypersensitive sites sequencing
|
Источники одобрены
|
Изотова
|
FAIRE-Seq
|
|
|
Гуляева, Козлова
|
Иммунопреципитация
|
В списке изначально был RIP-[seq, chip, etc], однако это при отсутствии статьи по иммунопреципитации это как-то преждевременно
|
Источники одобрены
|
Ярахмедов, Иванов
|
Профилирование РНК
|
Статья должна описывать основные типы анализа клеточной РНК сгруппированные по ее (РНК) типу: по биологическому типу: polyA/not-polyA, short, microRNA, non-coding RNA, etc.; по локализации: цитоплазма, ядро, ядрышко и т.д. - см варианты в ENCODE.
|
|
Джумашев, Коннова
|
Кэп-анализ экспрессии генов
|
Cap analysis gene expression
|
Источники одобрены
|
Калинина
|
ДНК-микрочип
|
Существующая статья совсем маленькая
|
Источники одобрены
|
Карпов, Евсютина
|
Секвенирование спаренных концов
|
Необоходимо написать общую статью про PET и добавить разделы или отдельные статьи про RNA-PET (Карпов) и про DNA-PET (Евсютина)
|
Источники одобрены
|
Карпова
|
Секвенирование РНК
|
RNA-seq
|
Источники одобрены
|
Дзама, Маллохассани
|
Альтернативный сплайсинг
|
Существующая статья совсем маленькая.
|
Источники одобрены
|
Кирюхина
|
ChIP-seq
|
необходимо взаимодействие с авторами статьи про иммунопреципитацию
|
|
Лопатина
|
Определение конформации хромосом
|
en:Chromosome conformation capture
|
Источники одобрены
|
Максимычев
|
ChIA-PET
|
en:ChIA-PET
|
Источники одобрены
|
Журавлева, Нафеев
|
Позиционирование нуклеосом
|
|
Источники одобрены
|
Золотарева, Рябичко
|
Протеомика
|
Должны быть описаны основные варианты масс-спек анализа протеомов.
|
Источники одобрены
|
Караваева, Тухбатова
|
Профилирование репликации
|
Repli-chip, Repli-seq
|
Источники одобрены
|
Кузнецов
|
Двугибридный анализ
|
|
Источники одобрены
|
Маслова, Миссарова
|
Методы секвенирования нового поколения Высокоэффективное секвенирование
|
Небольшая статья про просто секвенирование уже есть. Следует либо дополнить ее, либо написать новую. В последнем случае надо не забыть добавить ссылку на статью про секвенирование. Необходимо взаимодействие с участниками, пишущими про отдельные методы
|
Источники одобрены
|
Медведева, (Ширшиков отказался)
|
Illumina/Solexa_method
|
Существует статья про компанию, нужна про принцип метода.
|
|
Мигур, Пятницкий
|
SOLiD
|
|
Источники одобрены
|
Мукосей, Лапшин
|
Helicos Biosciences
|
|
Источники одобрены
|
Никулина
|
Polony sequencing
|
|
Источники одобрены
|
Потанин
|
Ion semiconductor sequencing
|
|
Источники одобрены
|
Нарайкина, Шелякин
|
Одномолекулярное секвенирование в реальном времени
|
|
Источники одобрены
|
Борисевич
|
Нанопоровое секвенирование
|
|
Источники одобрены
|
Попков, Сапунов
|
Картирование коротких ридов
|
надо подумать над названием
|
Источники одобрены
|
Свистунова, Солдатов
|
Инкубатор:Количественный анализ экспрессии генов
|
|
Источники одобрены
|
Синицын, Ступников
|
Количественный анализ альтернативного сплайсинга
|
|
Источники одобрены
|
Сливко-Кольчик, Танас
|
differential (two samples) analysis of gene expression and alternative splicing
|
надо написать разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про time series.
|
Источники одобрены
|
Червонцева, Тетерина
|
time series analysis of gene expression and alternative splicing
|
Дописать необходимые разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга. Необходимо обратить внимания на все сложные модели (кроме попарных сравнений) а не только на временные зависимости. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про парные сравнения.
|
Источники одобрены
|
Чернецова, Труханов
|
Однонуклеотидный полиморфизм
|
дописать саму статью и добавить методы поиска
|
Источники одобрены
|
Шерстюк, Чуклина, Мухина
|
Полногеномный поиск ассоциаций
|
Так как на русском статьи про GWAS нет, то стоит начать с нее, а "SNP imputation" сделать разделом или отдельной страницей - в зависимости от объема.
|
Источники одобрены
|
Давтян
|
|
Предлагается примкнуть к группе пишущей про GWAS
|
|
Балычев
|
Выравнивание последовательностей
|
en:Sequence alignment
|
Перевод с английского
|
|
|