Меню Главная Случайная статья Настройки Молекулярный редактор Материал из https://ru.wikipedia.org Молекулярный редактор — специализированная компьютерная программа, позволяющая вводить, редактировать и выводить на внешние носители информации (на бумагу, на экран) информацию о составе и структуре молекул веществ. Для работы с химическими документами в большинстве случаев невозможно использовать только текстовые или графические редакторы общего назначения. Редактирование текстов, содержащих химическую информацию, требует использования специализированных программных инструментов. Общий подход к созданию интерфейса химических редакторов заключается в том, что химические формулы собираются по принципу конструктора из структурных элементов (ароматические кольца, символы химической связи, стрелки и т.п.). Формула и отдельные её фрагменты могут быть модифицированы (вставка необходимых символов, изменение размера или ориентации на плоскости). Как правило, химические редакторы снабжаются комплектами заготовок сложных формул и рисунков(шаблонов), наиболее часто употребляемых в работе (аминокислоты, пептиды, углеводы, стереоизомеры, нуклеотиды, лабораторное оборудование). Многие снабжены модулями по именованию соединений в соответствии с номенклатурой. Химические редакторы позволяют выполнять следующие функции: создавать на экране химические структурные формулы, схемы реакций, лабораторные установки; конструировать объемные молекулярные модели и выполнять манипуляции с ними (увеличение или уменьшение моделей, вращение и перемещение их и т.д.); рассчитывать энергетические и пространственные параметры системы (распределение электронной плотности, энергию и длину связей, валентные углы и т.п.); рассчитывать энергию молекулы в стационарном и возбужденных состояниях на основе классической механической модели осциллирующих атомов; рассчитывать другие молекулярные характеристики и вероятность пути прохождения химических реакций. Представители молекулярных редакторов: Программа ОС Лицензия ChemDraw Windows, Mac OS Проприетарная ACD/ChemSketch[1] Windows(64-bit) Проприетарная XDrawChem[2] Кроссплатформенный GPL BKchem[3] Кроссплатформенный GPL JChemPaint Кроссплатформенный LGPL Jmol Кроссплатформенный LGPL Avogadro GPL Литература Наумов А.Р., Молчанова И.И. Основы эффективной работы с графическим редактором структурных химических формул ISIS/Draw. Практическое пособие - Кострома: КГУ им. Н. А. Некрасова, 2004. - 108 с. - ISBN 5-7591-0588-4 Zhenjiang Li, Honggui Wan, Yuhu Shi, and Pingkai Ouyang. Personal Experience with Four Kinds of Chemical Structure Drawing Software: Review on ChemDraw, ChemWindow, ISIS/Draw, and ChemSketch. — ACD Publications, 2004. Примечания Chemical Structure Drawing Software | ACD/ChemSketch  (неопр.). www.acdlabs.com. Дата обращения: 5 февраля 2021. Архивировано 11 января 2021 года. XDrawChem (англ.). SourceForge. Дата обращения: 5 февраля 2021. Архивировано 1 февраля 2022 года. BKChem  (неопр.). bkchem.zirael.org. Дата обращения: 5 февраля 2021. Архивировано 23 мая 2021 года.