Роберт Рохас начинал свою карьеру футболиста в парагвайском «Гуарани». 3 февраля 2017 года он дебютировал в парагвайской Примере, выйдя в основном составе в гостевой игре с «Либертадом»[2]. 14 мая того же года Рохас забил свой первый гол на высшем уровне, выведя свою команду вперёд в счёте в домашнем поединке с клубом «Спортиво Лукеньо»[3].