Карлос Альфредо Санчес начинал свою профессиональную карьеру футболиста в гондурасском клубе «Марафон». 14 марта 2011 года он забил свой первый гол в рамках Национальной лиги Гондураса, открыв счёт в гостевом поединке против «Платенсе»[2]. С 2012 по 2014 год Санчес представлял «Гондурас Прогресо» из своего родного города. Первую половину 2015 года он провёл за команду «Реал Эспанья», после чего вернулся в «Гондурас Прогресо». Летом 2018 года перешёл в «Мотагуа», хотя ранее сообщалось об интересе к нему со стороны испанского «Тенерифе»[3].