Основана в посёлке (тогда) Дидубе в 1975 году схиархимандритом Виталием (Сидоренко) († 1 декабря 1992 года), пострижеником Глинской пустыни, и митрополитом Зиновием (Мажуга) в небольшом доме первого, где кроме Виталия проживала также его келейница монахиня Мария (Дьяченко).
Последняя была настоятельницей монастыря до своей смерти в 2006 году.
Монастырь окормляет Католикос-Патриарх всея Грузии Илия II.