Сиопис — воспитанник клуба «Олимпиакос». Летом 2013 года Манолис перешёл на правах аренды в «Платаньяс». 17 августа в матче против «Верии» он дебютировал в греческой Суперлиге[3]. Летом 2014 года Манолис на правах свободного агента перешёл в «Паниониос». 25 августа в матче против «Эрготелиса» он дебютировал за новую команду[4]. Летом 2017 года Сиопис вернулся в «Олимпиакос». 25 июля в поединке квалификации Лиги чемпионов против белградского «Партизана» он дебютировал за основной состав[5]. В то же трансферное окно Манолис на правах аренды вернулся в «Паниониос».