С 8 сентября 2012 года Смолдерс замужем за актёром Тараном Киллэмом, с которым встречалась пять лет до свадьбы[3]. У супругов две дочери — Шейлин Кадо Киллэм (род. 16 мая 2009)[4] и Джанита Мэй Киллэм (род. в январе 2015).
Болезнь
В 2015 году Смолдерс призналась, что в 25-летнем возрасте, во время съёмок третьего сезона «Как я встретил вашу маму», у неё был диагностирован рак яичников. Она перенесла операцию по удалению двух опухолей из яичников, но рак распространился на лимфатические узлы, что привело к необходимости проведения нескольких операций в течение двух лет. В августе 2019 года Смолдерс сообщила, она находится в ремиссии[5].