В 1791 году он вернулся в Альтону — профессором гимназии, в которой 20 лет назад он начинал учиться; в 1794 году стал в ней директором и библиотекарем.
В 1808 году в Альтоне был напечатан его учебник арифметики.
В 1813 году получил докторскую степень в Кильском университете.
До 1826 года он преподавал древние языки латынь, греческий и иврит, а также догматику и экзегезу в Селекте, высшем классе гимназии в Альтоне. Продолжал свои исследования в области алгебры, геометрии, теории вероятностей и теории чисел, основанные на работах Кестнера, Леонарда Эйлера и Клюгеля; в период 1800—1827 годов опубликовал более 20 своих статей по математике.
В 1827 году вышел в отставку. Умер 2 апреля1841 года в возрасте 85 лет.
Семья
В 1783 году женился на Марии Эмерентии Визе (8 сентября 1764 — 14 июля 1847) из Гамбурга. У них было пятеро сыновей и две дочери:
Мария Эмерентия была дочерью пастора Иоганна Визе (нем.Johann Heinrich Ludwig Wiese; 1726—1804), отправившегося в Россию капелланомПетра III. Это могло повлиять на дальнейшее переселение части рода Струве в Российскую империю; так, сыновья Струве могли покидать Германию, чтобы избежать призыва в наполеоновские армии.