В 1950 году устроился во Всесоюзный институт геологии (ВСЕГЕИ), где до 1953 года занимал должность библиографа, а потом — начальника справочно-библиографического отдела. В 1957 году переведен на должность младшего научного сотрудника сектора тюркологии и монголистики Ленинградского отделения Института востоковедения АН СССР. С 1960 по 1962 годы заведовал библиотекой ЛО ИВАН СССР[1].
В 1962 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Древнетюркские рунические памятники как источник по истории Средней Азии» (научные руководители — А. Н. Бернштам и С. Е. Малов). В 1963 году стал заведующим сектором тюркологии и монголистики ЛО ИВАН СССР (впоследствии СПб ФИВ РАН) и занимал данную должность до 2013 года. Принимал активное участие в археологических экспедициях[1].
С 1964 года — сотрудник сектора. C 1969 года — преподаватель кафедры Тюркской филологии ЛГУ, с 1995 — преподаватель кафедры Центральной Азии и Кавказа СПбГУ. С 1992 года — профессор[1].
С 2013 года был ведущим сотрудником сектора Центральной Азии и отделом Центральной и Южной Азии ИВР РАН. В 2014 году вышел на пенсию. Ушёл из жизни 21 сентября того же года[1].
В 2005 году награждён Золотой медалью Постоянной международной алтаистической конференции (Gold Medal of the Permanent International Altaistic Conference).
Основные публикации
Кляшторный С. Г. Древнетюркские рунические памятники как источник по истории Средней Азии / С. Г. Кляшторный. — М., 1964.