Территория Миннесота была образована из части Территории Айова. Она занимала территорию современного штата Миннесота и большую часть территории к востоку от реки Миссури, позже ставшей Территорией Дакота. Территория Миннесота также включала часть Территория Висконсин, расположенной между рекой Миссисипи и Висконсином, которая не вошла в состав штата Миннесота.