Клан Тодо происходил из района Инуками в провинции Оми. В период Эдо клан Тодо управлял большей частью провинции Исэ и всей провинцией Ига в качестве даймё Цу-хана с доходом 320 000 коку риса.
Во время периода Бакумацу Тодо Такаюки, даймё Цу-хана (1825—1871) в 1868 году перешел на сторону коалиции Сацума-Тёсю (Союз Саттё), что привело к победе коалиции над армией сёгуната в битве при Тоба-Фусими. Позднее глава клана Тодо был награждён титулов графа (, хакусяку) в новой японской аристократической системе (кадзоку).
Младшая ветвь клана Тодо правила в домене Хисаи-хан в провинции Исэ с доходом 53 000 коку. В период Мэйдзи глава этой линии клана был удостоен титула виконта (, сисяку). Другая младшая линия клана, не имевшая титула даймё, управляла Набари-ханом в провинции Ига с доходом 15 000 коку. В период Мэйдзи главе этой ветви клана Тодо получил титул барона (, дансяку) в новой аристократической системе — кадзоку.