Хёген играл несколько сезонов за «Будё-Глимт», но был переведен в клуб «Тромсё» в преддверии сезона 2007.
В течение первого года он выходил на поле в качестве замены Патриса Бернье, в качестве центрального полузащитника.
Томы был назван игроком года в «Тромсе» в сезоне 2008 и имел прозвище «Супер Том». Это прозвище он получил будучи ещё в команде «Будё-Глимт».
29 мая 2011 года он забил свой первый гол за «Тромсё» в игре с «Бранном», где «Тромсё» выиграл с итоговым счетом 4-0.
В 2011 году, Хёгли подписал контракт с бельгийским клубом «Брюгге».
После трех сезонов в клубе «Брюгге», Хёгли в 2014 году договорился вступить за датский клуб «Копенгаген» после истечения контракта 1 июля 2014 года.[3]