Фаринья — воспитанник клубов «Рио Абахо» и «Пласа Амадор». В 2020 году он перешёл в «Атлетико Насьональ», за который выступал во Втором дивизионе Панамы. В 2021 году Фаринья перешёл в «Индепендьенте Ла-Чоррера». 14 августа в матче против «Верагуас Юнайтед» он дебютировал в чемпионате Панамы[1]. В начале 2022 года Фаринья на правах аренды перешёл в «Университарио». 23 июля в матче против «Сан-Франсиско» он дебютировал за новый клуб[2]. 25 сентября в поединке против «Пласа Амадор» Эдгардо забил свой первый гол за «Университарио»[3]. Летом 2023 года Фаринья был арендован гватемальским клубом «Мунисипаль». 6 августа в матче против «Депортиво Ачуапа» он дебютировал в чемпионате Гватемалы[4]. В своём дебютном сезоне Эдгардо стал чемпионом Гватемалы. По окончании аренды игрок вернулся в «Индепендьенте Ла-Чоррера».
Летом 2024 года Фаринья перешёл в российский «Химки». 3 августа в матче против «Рубина» он дебютировал в РПЛ[5]. В этом же поединке Эдгардо забил свой первый гол за «Химки».
24 июля 2025 года заключил трёхлетний контракт с «Пари НН»[6].
Рубин VS. Химки 2:3(англ.). soccerway.com (3 августа 2024). Дата обращения: 10 августа 2024. Архивировано 4 августа 2024 года.
Пресс-служба ФК «Пари Нижний Новгород».Эдгардо Фаринья – в «Пари НН»! (неопр.)Официальный сайт ФК «Пари Нижний Новгород» (24 июля 2025). Дата обращения: 24 июля 2025. Архивировано 24 июля 2025 года.