Рапаллини начал свою судейскую карьеру в 2001 году. Помимо работы в качестве судьи, он трудится в Ла-Плате в семейной компании, которая специализируется на строительстве бассейнов.
С 2006 года Рапаллини обслуживает матчи аргентинской национальной лиги B, с 2011 года работал в высшем дивизионе чемпионата Аргентины. Он судил финал Кубка Аргентины по футболу 2017 года[1], финал Суперкубка Аргентины 2019 года и единственного розыгрыша Трофей Чемпионов Суперлиги Аргентины.
В 2014 году он получил право судить международные матчи и стал судьёй ФИФА. Его международный дебют состоялся в марте 2015 года в матче предварительного раунда чемпионата Южной Америки по футболу среди юношей до 17 лет между Парагваем и Бразилией. Первый матч основных сборных на мировом уровне он отработал в июне того же года в товарищеском поединке между Чили и Сальвадором. В 2019 году Рапаллини получил первое приглашение на большой футбольный турнир, отработал на двух играх группового этапа молодёжного чемпионата мира в Польше. Также судил матчи в южноамериканских клубных соревнованиях. В феврале 2020 года он был назначен главным судьёй на ответный матч Рекопы Южной Америки 2020 года между Фламенго и Индепендьенте дель Валье[2].
В 2021 году был приглашён работать на матчах чемпионата Европы по футболу 2020 года. Рапаллини стал первым южноамериканским судьёй и вторым неевропейцем, который обслуживал игры на чемпионате Европы по футболу. Отработал три игры[3].