В 1993 году Филатов дебютировал в Высшей лиге чемпионата России по мини-футболу в составе московского «Минкаса». Он так удачно провёл сезон, что был признан лучшим вратарём чемпионата России. После этого Владимир выступал за «Минкас» до 1996 года и больше на высоком уровне не играл.