После смерти отца в 1691 году Фридерика проживала со своей мачехой Кристиной Баден-Дурлахской в Альтенбургском дворце. Когда в 1693 году брат Фридерики Фридрих II был объявлен совершеннолетним и пришёл к власти, она вернулась к готскому двору и оказывала брату поддержку в управлении герцогством вплоть до своего замужества.
25 мая 1702 года в Цербсте Фридерика вышла замуж за будущего князя Ангальт-Цербста Иоганна Августа, став и для него хорошей советчицей в вопросах управления. Счастливый брак продлился семь лет до смерти Фридерики, не оставившей Иоганну Августу наследников.